过敏性结膜炎在临床上表现出的眼痒、异物感和结膜充血等并不是其特有的症状与体征，这些症状与体征在其它眼表疾病亦可出现，比如干眼、沙眼、睑缘炎、慢性结膜炎等。临床上在诊断过敏性结膜炎时容易与这些疾病相混淆，也是其临床诊断的难点。
临床上对眼红、痒的患者进行详细的病史询问是非常重要的。季节性过敏性结膜炎以中青年最常见，呈季节性发作，常在春季，起病迅速，接触过敏原时发作，脱离过敏原后痒感及结膜充血迅速缓解或消失；常年性过敏性结膜炎与季节性过敏性结膜炎症状相似，但表现为常年存在，在临床中问病史时患者常常会主诉经常打喷嚏，或临床确诊合并有过敏性鼻炎、哮喘及过敏性皮炎等，由于季节性过敏性、常年性过敏性结膜炎缺乏特殊的临床体征，所以问诊就成为诊断时的主要或唯一手段；接触性过敏性结膜炎有明确的药物、食品、化妆品、化学物质等在眼部的接触史等，比如外敷药物、更换化妆品、室内新装修、海鲜通过手接触等；春季角结膜炎多见于青少年，20岁以下，男：女≈3：1，首次发病多见于10岁以前，常在4-8月份发生或加重；特应性角结膜炎多见于30-50岁中年男性，仔细询问多有轻度过敏史，95%患者合并皮肤湿疹；巨乳头性结膜炎则见于长期佩戴角膜接触镜、义眼片以及眼表有缝线或结膜下植入物，比如双眼皮手术埋线法线头外露，青光眼阀植入的患者等等。